布袋除塵器的運轉可以分為試運轉與日常運轉。首先，進行試運時，對除塵系統的單一部件進行檢查，然后做適應性運轉，并要作部分性能試驗。在日常運轉中，仍應當進行必要的檢查，尤其是對布袋除塵器的性能檢查。要注意主機設備負荷的變化會對除塵器性能產生的影響。在機器開動后，應當密切注意袋式除塵器的工作狀況。做好相關的記錄。
試運轉，在新的布袋除塵器試運行時，要特別注意檢查一下幾點：
1、風機的旋轉方向、轉速、軸承振動和溫度。
2、處理風量和各測試點壓力與溫度是否與設計相符。
3、除塵布袋的安裝情況，在使用后是否有掉袋、松口、磨損的情況發生，投運可目測煙囪的排放情況來判斷。
4、要注意袋室結露情況是否存在，排灰系統是否暢通。防止堵塞和腐蝕發生，積灰嚴重時會影響主機的生產。
5、清灰周期及清灰時間的調整，這項工作是左右捕塵性能和運轉狀況的重要因素。清灰時間過長，將使附著粉塵層被清落掉，成為濾袋泄漏和破損的原因。如果清灰時間過短，濾袋上的粉塵尚未清落掉，就恢復過濾作業，將使阻力很快地恢復并逐漸增高起來，終影響其使用效果。
兩次清灰時間間隔稱清灰周期，一般希望清灰周期盡可能的長一些，使除塵器能在經濟的阻力條件下運轉。因此，對粉塵性質、含塵濃度等進行慎重地研究，并根據不同的清灰方法來決定清灰周期和時間，并在試運轉中進行調整達到較佳的清灰參數。
在開始運轉的時間，常常會出現一些事先預料不到情況，例如，出現異常的溫度、壓力、水分等將給新裝置造成損害。氣體溫度的急劇變化，會引起風機軸的變形，造成不平衡狀態，運轉就會發生振動。一旦停止運轉，溫度急劇下降，再重新啟動時就又會產生振動。好根據氣體溫度來選用不同類型的風機。設備試運轉的好壞，直接影響其是否能投入正常運行，如處理不當，袋式除塵器很可能會很快失去效用，因此，做好設備的試運轉細心和慎重。